Sarebbe da vede' il codice altrimenti...
Se, ad esempio, hai i numeri dei capitoli individuati dai tag <Hn> ( con H= tag html che imposta capitoli e sottocapitoli) hai vita facile: basta solo imporre che il testo del libro sia allineato a sinistra ed hai fatto.
Altrimenti tocca vedere come e' impostato l'allineamento del numero_capitolo e l'allineamento del testo e agire sul CSS.
Se non ricordo male, tu sei un adepto della Chiesa del Kindle... La Luna consiglierebbe[1] di convertire in epub, lavorare su quello magari con sigl e poi riconvertire in azwqualcosa.
[1] Consiglierebbe perche' io se devo fare conversoni, preferisco farle via epub o con sigil, oppure acquisendo l'epub ( se malandato) in libreoffice e pioi fare tutto il pippone. So che calibre ha il toolino per modifica' i file per kindle ma:
a) non l'ho mai usato;
b) gia' fatico a usare sigil che fa troppo come gli pare, figurati calibre. VIM e' La Via, se solo ci pigli mano
;-))
Se puoi, manda un (frammento di) esempio del codice sia del testo che del Css che poi vediamo.
HP